Características do Cluster

Softwares instalados:

Filogenia: mrbayes, muscle, clustaw, beast, raxnlHPC-MPI, RepeatMasker, Gromacs
Linguagens: C, C++, Fortran, Perl, Python, Java

Hardware:

  • Head Node – jupiter – com:
    • 2 processadores Intel(R) Xeon(R) CPU X5650 @ 2.67GHz;
    • 48 GB de RAM DDR3 1333 Mhz;
    • 8 TB de capacidade de armazenamento;
    • 1 porta QDR infiniband de 40 Gbs;
  • 15 nós de trabalho, cada um com:
    • 2 processadores Intel(R) Xeon(R) CPU X5650 @ 2.67GHz;
    • 24 GB de RAM DDR3 1333 Mhz;
    • 512 GB de capacidade de armazenamento;
    • 1 porta QDR infiniband de 40 Gbs;
  • 1 Storage – urano – com:
    • 2 processadores Intel(R) Xeon(R) CPU X5650 @ 2.67GHz
    • 48 GB de RAM DDR3 1333 Mhz;
    • 98.2 TB de capacidade disponível de armazenamento em RAID 6.
  • Nó GPU – gn001 – com:
    • 2 processadores Intel(R) Xeon(R) CPU X5650 @ 2.67GHz;
    • 24 GB de RAM DDR3 1333 Mhz;
    • 512 GB de capacidade de armazenamento;
    • 2 GPU’s Tesla C2050 cada uma com:
      • 448 núcleos CUDA;
      • 1,15 GHz de freqüência dos núcleos CUDA;
      • 3GB de memória dedicada GDDR5;
      • Interface de memória de 384-bit;
  • 1 nó de Teste e Desenvolvimento – venus – com:
    • 2 processadores Intel(R) Xeon(R) CPU E5630 @ 2.53GHz;
    • 2 GB de RAM DDR3 1333 Mhz;

    • 1 TB de capacidade de armazenamento